Rak: Ti 4 geni pomagajo napovedati izid
Obsežne raziskave vloge supresorja tumorjev p53 ponujajo boljše razumevanje genskih mutacij, ki se pojavljajo pri različnih oblikah raka, pa tudi opredelitev štirih genov, ki lahko pomagajo napovedati človekovo perspektivo.
The TP53 gen je odgovoren za kodiranje tistega, kar znanstveniki imenujejo tumorski protein p53 - supresor tumorja, ki lahko ustavi prehitro delitev in razmnoževanje celic.
Raziskovalci so sinhronizirali TP53 "varuh genoma" zaradi njegove ključne vloge pri preprečevanju tumorjev in nadzoru celične delitve.
Človeški rak ima pogosto mutacije v TP53 gen, zaradi česar eden od kritičnih obrambnih mehanizmov pred rakom propade.
Prve študije, ki so ugotovile TP53 mutacije pri človeškem raku so se pojavile v osemdesetih letih in od takrat so raziskovalci veliko časa in sredstev namenili razjasnitvi njegove vloge pri raku.
Zdaj največja tovrstna študija uporablja vzorce tumorjev več kot 10.000 bolnikov z rakom in preučuje 32 različnih vrst raka, da bi bolje razumela vlogo TP53.
Dr. Larry Donehower, profesor molekularne virologije in mikrobiologije na Medicinski fakulteti Baylor v Houstonu v Teksasu, je vodil novo raziskavo, ki je objavljena v reviji Poročila o celicah.
Geni Telltale 4 lahko pomagajo napovedati obete
Dr. Donehower in njegova ekipa sta uporabila pet različnih podatkovnih platform za pridobivanje 10.225 vzorcev iz 32 vrst raka. Z uporabo atlasa genoma raka (TCGA) so raziskovalci lahko celovito ocenili vlogo poti p53 pri teh 32 vrstah raka.
Donehower in sodelavci so nato podatke TCGA primerjali z drugo zbirko podatkov o 80.000 genskih mutacijah, ki jih je dr. Thierry Soussi, profesor molekularne biologije na univerzi Sorbonne v Parizu v Franciji, sestavljal v obdobju 30 let.
Raziskovalci so to ugotovili TP53 mutacije so se pogosteje pojavljale pri ljudeh, ki so imeli slabši pogled. Poleg tega je analiza pokazala, da „Več kot 91% rakavih obolenj z TP53 mutacije kažejo izgubo obeh funkcionalnih TP53 aleli «, ali genske različice.
Dr. Donehower pojasnjuje: "V nekaterih genih za raka boste videli eno kopijo izgubljenih ali mutiranih genov," vendar "več kot 91 odstotkov vseh vrst raka izgubi oba TP53 geni, ne samo en. "
Do izgube drugega alela, kot so zapisali avtorji, je prišlo z "mutacijo, kromosomsko delecijo ali nevtralno kopijo izgubo heterozigotnosti" - to je podvajanje genov. Vodilni raziskovalec tudi ugotavlja, da se je zadnji postopek zgodil veliko pogosteje, kot so prej verjeli.
Pomembno je, da je raziskava odkrila tudi štiri gene, ki so pokazali prekomerno izražanje pri mutantu TP53 tumorji. Po mnenju raziskovalcev lahko ti štirje geni "povedo", ali ima bolnik z rakom dobre obete ali ne.
"Če imate visoko izraženost teh štirih genov, imate pacienta, za katerega je verjetnost, da ima slabo prognozo [...] Nasprotno, če ima ta bolnik zelo nizek izraz teh genov, bo verjetno preživel dlje in imel dobra prognoza. "
Dr. Larry Donehower
»Dala vam bo boljšo sliko, kako se bo odrezal, kot pa samo vedeti, ali je mutant TP53 ali ne, «nadaljuje dr. Donehower.
Končno je študija močno povezana TP53 mutacije z genomsko nestabilnostjo, kar je v skladu z TP53Tipična vloga "varuha genoma."
Dr. Donehower komentira edinstvenost nove raziskave in pravi: »Večina študij o TP53 osredotočiti se na eno vrsto raka. "
"Če pogledamo 32 različnih vrst raka, vidimo, da nekateri vzorci držijo ne glede na vrsto raka."
Pomembnost ugotovitev komentira tudi soavtor študije in direktor Genomics of Cancer na Medicinski fakulteti Baylor, dr. David Wheeler.
Pravi: »Od takrat TP53 je eden najpomembnejših vratarjev pri preprečevanju raka, boljše kot bomo razumeli ta gen, bolje bomo razumeli osnovno biologijo raka. To bo pripeljalo do boljših terapij. "
