Rak prostate: Veliki podatki odklenejo 80 novih ciljev na droge
V največji študiji za analizo genetike raka na prostati so znanstveniki našli nič manj kot 80 novih potencialnih tarč zdravil. Projekt odpira široko pot za oblikovanje novih načinov zdravljenja.
Pridobivanje genskih podatkov je bilo nekoč okorno in neverjetno dolgotrajno opravilo.
Ker pa se tehnologija še naprej izboljšuje, je delo postalo bistveno hitrejše in cenejše.
Vzporedno s tem so se močno izboljšala orodja, ki so na voljo za obdelavo velikih naborov podatkov.
Skupaj to pomeni, da je ocean podatkov, pridobljenih iz genetske kode, mogoče analizirati, preslikati in z relativno lahkoto združiti, da se zagotovi nova raven jasnosti.
Pred kratkim je mednarodna ekipa uporabila ta dvojni pristop analize DNA in velike podatke, da bi se poglobila v genetiko raka prostate. Na področju lova na molekularne žlebove v oklepu bolezni je raziskavo organiziral Inštitut za raziskave raka v Londonu v Združenem kraljestvu.
Izzivi raka prostate
Rak prostate je drugi najpogostejši rak med moškimi v ZDA. Letos bo v ZDA ocenjenih 164.690 novih primerov raka prostate in skoraj 30.000 smrtnih primerov zaradi bolezni.
Čeprav so raziskovalci napredovali pri razumevanju in zdravljenju raka prostate, še vedno obstajajo številne težave.
Kot pojasnjuje vodja raziskave prof. Rosalind Eeles, "je eden od izzivov, s katerimi se srečujemo pri raziskavah raka, zapletenost bolezni in veliko načinov, kako bi jo lahko zdravili."
Dr. Justine Alford iz Cancer Research UK opisuje še eno vprašanje pri proučevanju in posredovanju pri raku prostate.
"Glavna ovira za nadaljnji napredek pri raku prostate je," pojasnjuje, "pomanjkanje načinov za natančno napoved napredovanja bolezni, zato je težko vedeti, katero zdravljenje je najboljše za vsakega bolnika."
Zbiranje genetskih podatkov
Da bi pristopili k problemu iz nove smeri, so raziskovalci od 112 moških z rakom prostate odvzeli genetske podatke in jih združili s podatki iz številnih drugih študij. Uporabljeni so bili vzorci 930 bolnikov.
Z uporabo najnovejših tehnik velikih podatkov je ekipa dobila nov vpogled v genetske spremembe, ki spodbujajo razvoj in spodbujajo napredek raka prostate. Ko so enkrat razumeli, za katere gene gre, so lahko ustvarili zemljevid beljakovin, ki jih ti geni kodirajo.
Nato so se obrnili na bazo podatkov, imenovano canSAR, ki združuje podatke iz študij, uporablja strojno učenje in pomaga zagotoviti vpogled v odkrivanje zdravil.
CanSAR na svoji spletni strani razloži vprašanja, na katera želi odgovoriti njihova baza podatkov: »Kaj je znano o beljakovini, pri katerem raku je izražen ali mutiran in s kakšnimi kemičnimi orodji in modeli celičnih linij lahko eksperimentalno preiskujemo njegovo aktivnost? Kaj je znano o zdravilu, njegovem celičnem profilu občutljivosti in na katere beljakovine se veže, kar lahko pojasni nenavadno bioaktivnost? "
Znanstveniki so ugotovili, da je 80 odkritih beljakovin potencialna tarča zdravil. In 11 od njih je bilo tarča obstoječih zdravil, sedem drugih pa bi lahko bila tarča zdravil že v kliničnih preskušanjih.
Njihove ugotovitve so objavljene ta teden v reviji Naravna genetika.
"Naša študija je uporabila vrhunske tehnike pri analizi velikih podatkov, da bi odkrila veliko novih informacij o raku prostate in možnih načinih za boj proti bolezni."
Prof. Rosalind Eeles
Pogled v prihodnost
Pred odkritji bodo seveda potrebna nadaljnja preučevanja, preden jih bomo lahko klinično uporabili, vendar ponujajo vrsto novih možnosti.
Kot pojasnjuje soavtor prof. Paul Workman: »Ta študija je odkrila izjemno veliko novih genov, ki spodbujajo razvoj raka na prostati, in nam dala ključne informacije o tem, kako izkoristiti biologijo bolezni in poiskati potencialno novo zdravljenje. "
Upa, da bo njihovo delo "spodbudilo val novih raziskav genskih sprememb in potencialnih tarč zdravil, ki so jih ugotovili, s ciljem, da bi morali bolniki čim prej izkoristiti."
Druga ovira pri načrtovanju zdravljenja raka prostate je način, kako bolezen pri vsakem posamezniku napreduje drugače. Zaradi tega je veliko težje odločiti, katere možnosti zdravljenja so najbolj primerne za vsakega bolnika.
Dr. Alford upa, da bo [...] močno izboljšalo naše razumevanje genetike, ki je v ozadju bolezni, [...] v prihodnosti bi to znanje lahko pomagalo zdravnikom, da bolje prilagodijo zdravljenje posameznikovemu raku, in upajmo, da bo več ljudi preživelo svojo bolezen. "
To so zgodnji dnevi, vendar bi lahko ugotovitve, ki jih bo prinesla naslednja generacija študij, spremenile to področje.
